Funkcionisanje sistema industrijske ventilacije se često ocenjuje kao neuspešno i nepouzdano.
Posledice slabih efekata rada sistema industrijske ventilacije su: prekomerna zagađenja radne sredine, taloženje prašine ili kondenzata po podu, prolazima, konstrukcijama ili tehnološkoj opremi, kao i velike emisije zagađivača u atmosferu, čime se zagađuje životna sredina.
Razlozi za loš rad sistema industrijske ventilacije mogu biti mnogostruki: loše projektno rešenje, nekvalitetna oprema, neuravnoteženosti sistema, nepravilno i neredovno održavanje, to sve može prouzrokovati da posle uspešno započetog rada sistemi brzo dolaze u nefunkcionalno stanje.
Svi navedeni nedostaci industrijske ventilacije se mogu svrstati u dve grupe: na pojedine je moguće uticati boljom organizacijom rada, dok je za druge potrebno naći odgovarajuća tehnička rešenja radi poboljšanja rada i laku kontrolu parametara i opreme.
Važno je naglasiti da sistemi industrijske ventilacije (otprašivanje, odsisavanje gasova i para) čine kompleksnu celinu i nikako se ne smeju poistovećivati sa samim uređajem za prečišćavanje. Na primer, beskorisno je ugraditi prečistač koji ima efikasnost preko 99%, ako odsisna hauba na samom početku instalacije uhvati samo 60% emitovanog zagađivača.